Office a genetyka: HGNC zmienia nazewnictwo, bo Excel zniekształcał wyniki

Office a genetyka: HGNC zmienia nazewnictwo, bo Excel zniekształcał wyniki06.08.2020 06:59
HGNC zmienia nazewnictwo, bo Excel zniekształcał wyniki (tło: Pixabay)

Komitet Nazewnictwa Genów Międzynarodowej Organizacji Badań nad Ludzkim Genomem zdecydował się zmienić nazwy szeregu substancji i procesów, ponieważ Microsoft Excel zastępował je innymi skutek automatycznej konwersji. Niektóre symbole były błędnie rozpoznawane jako miesiące, zmieniając nierzadko formatowanie kolumn w arkuszach z wynikami badań.

Masowe błędy

Jak skondlukowano w pewnym badaniu z 2016 roku (Ziemann, Yotam Eren, El-Osta), około 20 proc. wszystkich materiałów naukowych publikowanych przez genetyków zawiera błędy wynikające z automatycznej konwersji nazw, jakiej dokonuje Excel. Na przykład septyna, często oznaczana jako SEPT1, bywa rozumiana przez Excela jako data, w konsekwencji czego na wykresach i arkuszach widnieje nie pod swoją nazwą, a jako "01 wrz. 2020" i podobne. Zbliżony los spotyka sekwencje cDNA opisywane według konwencji ośrodka RIKEN. Excel uznaje ich zapis za notację wykładniczą, przez co zmienia typy serii danych.

Ponieważ łatwiej jest odgórnie zmienić nazewnictwo w całej dziedzinie naukowej niż przeszkolić wszystkich genetyków z obsługi Excela, HGNC zdecydowało się, o czym możemy przeczytać w Nature, zmienić nomenklaturę tak, aby uniknąć automatycznej konwersji komórek. Septyna nie będzie się już nazywać SEPT1, a SEPTIN1, dzięki czemu nigdy nie stanie się pierwszym września. Zmian jest więcej i dotyczą wielu niemających ze sobą wiele wspólnego kwestii.

Problem do uniknięcia

Dzięki nieprzejednaniu Excela, obowiązującą konwencją/praktyką w genetyce mają być też nowe nazwy dla symboli syntetazy tRNA. Nie są to zmiany rewolucyjne, a część z nich była wprowadzana po cichu już wcześniej. Poprzednie nie stają się też "błędne" lub wadliwe.

Konwersja typów danych (fot. Kamil Dudek)
Konwersja typów danych (fot. Kamil Dudek)

Dla porządku należy wspomnieć, że Excel umożliwia wyłączenie automatycznej konwersji poprzez odgórne ustalenie formatowania dla komórek. Gdy jawnie określimy treść komórki jako "tekst", Excel nie będzie próbował zgadywać typu danych w niej. Należy w tym celu zaznaczyć odpowiedni obszar i wybrać "Formatuj komórki..." z menu kontekstowego lub przycisku "Formatuj" sekcji "Komórki" na wstążce "Narzędzia główne".

Szanowna Użytkowniczko! Szanowny Użytkowniku!
×
Aby dalej móc dostarczać coraz lepsze materiały redakcyjne i udostępniać coraz lepsze usługi, potrzebujemy zgody na dopasowanie treści marketingowych do Twojego zachowania. Twoje dane są u nas bezpieczne, a zgodę możesz wycofać w każdej chwili na podstronie polityka prywatności.

Kliknij "PRZECHODZĘ DO SERWISU" lub na symbol "X" w górnym rogu tej planszy, jeżeli zgadzasz się na przetwarzanie przez Wirtualną Polskę i naszych Zaufanych Partnerów Twoich danych osobowych, zbieranych w ramach korzystania przez Ciebie z usług, portali i serwisów internetowych Wirtualnej Polski (w tym danych zapisywanych w plikach cookies) w celach marketingowych realizowanych na zlecenie naszych Zaufanych Partnerów. Jeśli nie zgadzasz się na przetwarzanie Twoich danych osobowych skorzystaj z ustawień w polityce prywatności. Zgoda jest dobrowolna i możesz ją w dowolnym momencie wycofać zmieniając ustawienia w polityce prywatności (w której znajdziesz odpowiedzi na wszystkie pytania związane z przetwarzaniem Twoich danych osobowych).

Od 25 maja 2018 roku obowiązuje Rozporządzenie Parlamentu Europejskiego i Rady (UE) 2016/679 (określane jako "RODO"). W związku z tym chcielibyśmy poinformować o przetwarzaniu Twoich danych oraz zasadach, na jakich odbywa się to po dniu 25 maja 2018 roku.

Kto będzie administratorem Twoich danych?

Administratorami Twoich danych będzie Wirtualna Polska Media Spółka Akcyjna z siedzibą w Warszawie, oraz pozostałe spółki z grupy Wirtualna Polska, jak również nasi Zaufani Partnerzy, z którymi stale współpracujemy. Szczegółowe informacje dotyczące administratorów znajdują się w polityce prywatności.

O jakich danych mówimy?

Chodzi o dane osobowe, które są zbierane w ramach korzystania przez Ciebie z naszych usług, portali i serwisów internetowych udostępnianych przez Wirtualną Polskę, w tym zapisywanych w plikach cookies, które są instalowane na naszych stronach przez Wirtualną Polskę oraz naszych Zaufanych Partnerów.

Dlaczego chcemy przetwarzać Twoje dane?

Przetwarzamy je dostarczać coraz lepsze materiały redakcyjne, dopasować ich tematykę do Twoich zainteresowań, tworzyć portale i serwisy internetowe, z których będziesz korzystać z przyjemnością, zapewniać większe bezpieczeństwo usług, udoskonalać nasze usługi i maksymalnie dopasować je do Twoich zainteresowań, pokazywać reklamy dopasowane do Twoich potrzeb. Szczegółowe informacje dotyczące celów przetwarzania Twoich danych znajdują się w polityce prywatności.

Komu możemy przekazać dane?

Twoje dane możemy przekazywać podmiotom przetwarzającym je na nasze zlecenie oraz podmiotom uprawnionym do uzyskania danych na podstawie obowiązującego prawa – oczywiście tylko, gdy wystąpią z żądaniem w oparciu o stosowną podstawę prawną.

Jakie masz prawa w stosunku do Twoich danych?

Masz prawo żądania dostępu, sprostowania, usunięcia lub ograniczenia przetwarzania danych. Możesz wycofać zgodę na przetwarzanie, zgłosić sprzeciw oraz skorzystać z innych praw wymienionych szczegółowo w polityce prywatności.

Jakie są podstawy prawne przetwarzania Twoich danych?

Podstawą prawną przetwarzania Twoich danych w celu świadczenia usług jest niezbędność do wykonania umów o ich świadczenie (tymi umowami są zazwyczaj regulaminy). Podstawą prawną przetwarzania danych w celu pomiarów statystycznych i marketingu własnego administratorów jest tzw. uzasadniony interes administratora. Przetwarzanie Twoich danych w celach marketingowych realizowanych przez Wirtualną Polskę na zlecenie Zaufanych Partnerów i bezpośrednio przez Zaufanych Partnerów będzie odbywać się na podstawie Twojej dobrowolnej zgody.